AmpliSeq for Illumina BRCA Panel

The AmpliSeq for Illumina BRCA Panel ― это таргетная панель для изучения вариации в соматической и герминальной линиях генов BRCA1 и BRCA2. Основные характеристики:

Relevant Gene Content

Target all exonic regions and flanking intronic sequences of BRCA1 и BRCA2

Быстрый, оптимизированный рабочий процесс

Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день из всего 1 нг стартового материала высокого качества или 10 нг образца FFPE

Точные данные

Определение соматических мутаций as low as 5% variant allele frequency using local or cloud based analysis

Панель BRCA является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотек по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.

BRCA1 и BRCA2 представляют собой гены человека, являющиеся супрессорами опухолевого роста, которые в случае наличия определенных мутаций свидетельствуют о повышенном риске рака молочной железы и яичников. Эта ready-to-use панель экономит исследователям время и усилия по определению таргетов, разработке праймеров и оптимизации панелей.

Спецификации

Число ампликонов	всего 265, 2 пула (Пул 1: 132 ампликона. Пул 2: 133 ампликона)
Время анализа	5 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование)
Время ручного труда	<1,5 часа
Тип нуклеиновой кислоты	ДНК
Количество стартового материала	1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул)
Особенности содержимого	Exonic regions and the flanking intronic sequences of the BRCA1 and BRCA2
Multiplexing	96 dual index combinations
Механизм действия	Мультиплексная ПЦР
Для исследования каких видов подходит	Человек
Метод	Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing
Класс вариаций	Germline Variants, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants
Для работы с какими платформами подходит	iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме)
Специальные типы образцов	FFPE
Технология	Секвенирование