MiniSeq
MiniSeq
Простой и доступный секвенатор нового поколения
Качество и надежность технологии Illumina в компактном и доступном по цене секвенаторе! MiniSeq позволит Вашей лаборатории сделать NGS рутинным методом. MiniSeq подойдет для лабораторий любого размера - как для крупных, так и с небольшим потоком образцов.
MiniSeq сочетает в себе лучшие черты секвенаторов MiSeq и NextSeq: использование одноразовых картриджей с реагентами и упрощённую систему флюидики. MiniSeq обеспечивает исключительную скорость работы, и, при своих компактных размерах, позволяет получить до 7,5 Гб данных и порядка 25 млн. чтений всего за сутки.
Доступный настольный секвенатор
MiniSeq является одним из самых доступных секвенаторов, который обладает производительностью и надёжностью проверенной технологии NGS от Illumina. С MiniSeq секвенирование даже небольшого количества образцов является экономически выгодным. Его оптимизированный рабочий процесс обеспечивает быстрое секвенирование как ДНК, так и РНК. Небольшой размер позволяет легко разместить MiniSeq в лаборатории, не требуя специализированного вспомогательного оборудования.
Применения системы MiniSeq
Система MiniSeq позволяет исследователям легко переключаться между проектами, связанными с секвенированием как ДНК, так и РНК, включая профилирование путей передачи сигналов, профилирование твердых и гематологических опухолей и анализ герминативных мутаций.
Рабочий процесс: простой путь от библиотек к результатам
Система MiniSeq сочетает в себе лёгкость эксплуатации с интуитивно понятным пользовательским интерфейсом. Генерация кластеров и секвенирование объеденины в одном компактном настольном секвенаторе, благодаря чему у Вас не будет необходимости в дополнительном оборудовании. Просто загрузите проточную ячейку и картридж с реагентами в MiniSeq и запустите сиквенс одним нажатием кнопки. Вы можете посмотреть, как это просто в этой интерактивной демонстрации.
Подробнее прочесть о применении MiniSeq Вы можете здесь.
Удобное и интуитивно-понятное программное обеспечение
Мониторинг и анализ запуска секвенатора выполняется с помощью встроенного программного обеспечения, не требующего подключения к интернету. Прибор сам сделает за Вас сборку de novo или выравнивание на референсный геном и variant calling.
Генерация кластеров и секвенирование*
*Спецификации установки основаны на библиотеке управления Illumina PhiX при поддерживаемых размерах кластеров (129-165 k/mm2 clusters passing filter). Фактические параметры производительности могут варьироваться в зависимости от типа пробы, качества выборки и clusters passing filter. Все комплекты MiniSeq совместимы paired-end. Общее время включает генерацию кластеров, секвенирование и распознавание азотистых оснований с оценкой качества на системе MiniSeq.| Длина прочтения, п.о. | Общее время, ч | Мощность | |
|---|---|---|---|
|
MiniSeq System High-Output Kit |
2 × 150 |
≈24 | 6,6-7,5 Гб |
|
2 × 75 |
13 | 3,3-3,75 Гб | |
|
MiniSeq System Mid-Output Kit |
1 × 75 | 7 | 1,65-1,875 Гб |
| 2 × 150 | 17 | 2,1-2,4 Гб |
Фильтр прочтений или прохождения кластеров
|
|
MiniSeq System High-Output Kit |
MiniSeq System Mid-Output Kit |
|---|---|---|
|
Single Reads |
22–25 млн. |
7-8 млн. |
|
Paired-End Reads |
44–50 млн. | 14-16 млн. |
Показатели качества*
* Процент оснований >Q30 усреднён за полный запуск. Оценка качества (Q-score) ― это предсказание вероятности ошибки в распознавании азотистых оснований.|
MiniSeq System High-Output Kit |
MiniSeq System Mid-Output Kit |
|---|---|
|
> 80% оснований выше, чем Q30 (2 × 150 п.о.) |
> 80% оснований выше, чем Q30 (2 × 150 п.о.) |
|
> 85% оснований выше, чем Q30 (2 × 75 п.о.) |
|
| > 85% оснований выше, чем Q30 (1 × 75 п.о.) |
|
Эти характеристики делают MiniSeq подходящим для решения следующих задач:
1) Онкология
- анализ соматических мутаций в солидных опухолях (панели TruSight Tumor 15, линейка панелей AmpliSeq) и миелоидных новообразованиях (TruSight Myeloid)
- анализ предрасположенности к онкологическим заболеваниям (TruSight Cancer, панели AmpliSeq)
- исследование ракового транскриптома (TruSight Pan-Cancer) и фьюжнов (TruSight RNA Fusion, линейка панелей Archer Dx)
2) РНК-секвенирование
- кастомные панели TruSeq Targeted RNA Expression для оценки экспрессии генов
- RNA-Seq микроорганизмов, секвенирование РНК-вирусов
- изучение малых РНК (TruSeq Small RNA)
3) Таргетное секвенирование
- широкий выбор панелей для любых задач.
4) Полногеномное секвенирование небольших геномов (до 5 Mb)
Видеоссылки
