AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 ― это таргетная панель для изучения хотспотов 50 известных генов, ассоциируемых с раком, в соответствии с базой данных «Каталога соматических раковых мутаций» (COSMIC). Основные характеристики:

Содержимое набора

Таргеты ~2800 COSMIC мутаций из 50 онкогенов и генов-супрессоров опухолей.

Быстрый, оптимизированный рабочий процесс

Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день из всего 1 нг стартового материала высокого качества или 10 нг образца FFPE

Точные данные

Определение соматических мутаций as low as 5% variant allele frequency using local or cloud based analysis

Панель Cancer HotSpot является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотек по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.

Эта панель позволяет обнаруживать вариации в нескольких типах рака, включая раки легких, толстой кишки, молочной железы, яичников, меланомы и простаты. Эта ready-to-use панель экономит исследователям время и усилия по определению таргетов, разработке праймеров и оптимизации панелей.

Спецификации

Число ампликонов	всего 207, 1 пул
Время анализа	5 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование)
Время ручного труда	<1,5 часов
Тип нуклеиновой кислоты	ДНК
Количество стартового материала	1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул)
Особенности содержимого	хотспоты 50 генов с известными ассоциациями с раком
Multiplexing	96 dual index combinations
Механизм действия	Мультиплексная ПЦР
Для исследования каких видов подходит	Человек
Метод	Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing
Класс вариаций	Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants
Для работы с какими платформами подходит	iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме)
Специальные типы образцов	кровь, FFPE
Технология	Секвенирование