illumina DNA Prep
Nextera DNA Flex Library Prep Kit
Быстрый рабочий процесс для целого комплекса применений: для секвенирования и полного генома человека, и ампликонов, плазмид. микробов и др.
illumina DNA Prep
Быстрый рабочий процесс для целого комплекса применений: для секвенирования и полного генома человека, и ампликонов, плазмид. микробов и др.
illumina DNA Prep является универсальным набором для полногеномного секвенирования различных организмов.
-
Самая быстрая подготовка библиотек среди наборов Illumina (общее время ~ 3,5 часа)
-
Универсальный набор - подходит для различных типов образцов, количества стартового материала и областей применения
-
Оптимизированная производительность подготовки библиотеки, обеспечивающая надежные результаты
Экономьте время и ресурсы
Протокол illumina DNA Prep быстрый и простой для понимания. Химия тагментации на шариках сокращает общее время подготовки библиотеки до ~ 3,5 часов, от выделения ДНК до нормализации библиотеки.
Упростите работу в лаборатории
illumina DNA Prep подходит для работы с широким диапазоном количества стартового ДНК (1–500 нг), с различными типами образцов, как для малых, так и больших геномов. Рабочий процесс включает извлечение ДНК из крови, слюны или высушеных пятен крови или бактериальных колоний. Данный набор универсален и подходит как для секвенирования генома человека или других больших, сложных геномов, так и ампликонов или микробов.
Получите достоверные результаты
Принимая во внимание всевозможные запросы и требования различных исследований, illumina DNA Prep обеспечивает предсказуемый размер вставок, равномерное покрытие и оптимизированную производительность независимо от количества вводимой ДНК или размера генома. Технология, основанная на микро-шариках, сводит к минимуму расхождения и вероятность ошибок, что приводит к получению высоко воспроизводимых данных на всех системах секвенирования Illumina.
Универсальные параметры пропускной способности
24 CD индекса поставляются в пробирках, а 96 - в планшете.
Набор индексов IDT® - это новейший набор индексов, предлагающий до 96 уникальных двойных индексов для точного распределения прочтений и эффективного использования проточной ячейки.
В наборе индексов IDT® используются индексы из 10 пар оснований. Это требует внесения изменений в установки запуска сиквенса. Дополнительную информацию смотрите на странице техподдержки индексов Nextera DNA UD indexes.
Спецификации
|
Время анализа |
~ 3-4 часа от выделения ДНК до нормализованной библиотеки |
|---|---|
|
Время непосредственно ручной работы |
1-1,5 часа |
| Тип нуклеиновой кислоты | ДНК |
| Количество стартового материала |
Малые геномы (например, микробы): 1-500 нг ДНК. Большие геномы (например, человека): 100-500 нг ДНК. |
| Описание |
Быстрый, универсальный рабочий процесс для целого комплекса исследовательских применений и типов образцов: подходит для полногеномного секвенирования и микробов, и человека; и многого другого. |
| Мультиплексирование |
до 96 доступных уникальных двойных индексов |
| Механизм действия |
bead-linked transposome |
|
Для исследования каких видов подходит |
Любые виды, человек, мышь, крыса, растение, дрозофила, вирус, дрожжи, данио, бактерии, млекопитающее, нематода |
| Таргетный размер вставки |
~500 п.о. |
| Метод |
Секвенирование ампликонов, De Novo секвенирование, Shotgun секвенирование, Полногеномное секвенирование |
| Класс вариаций |
Хромосомные аномалии, Варианты числа копий (CNV), Фьюжены генов, Герминальные варианты, Инделы (вставки-делеции), Потеря гетерозиготности (LOH), Однонуклеотидный полиморфизм (SNP), Соматические варианты, Structural Variants, Структурные варианты |
| Для работы с какими платформами подходит |
HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, HiSeq X Five, HiSeq X Ten, iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, MiSeq Dx (в исследовательском режиме), NextSeq 500, NextSeq 550, NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме), NovaSeq 6000 |
| Специальные типы образцов |
Кровь, несовместимые с FFPE, слюна |
| Особенности в зависимости от типа образца | Поддерживает несколько типов образцов, включая геномную ДНК, кровь (включая высушеные пятна крови), слюну, ампликоны ПЦР, плазмиды и бактериальные колонии |
| Технология | Секвенирование |
| Возможность автоматизации | Автоматические станции пипетирования |
Рекомендации по проекту
|
Секвенатор |
Рекомендуемое количество образцов |
Длина прочтения |
|---|---|---|
|
NextSeq 550 |
1 образец за запуск (high output; на основе 30-кратного покрытия генома человека) | до 2 х 150 п.о. |
|
HiSeq 2500 |
2–10 образцов за запуск (двухпотоковая ячейка; на основе 30-кратного покрытия генома человека) |
до 2 х 125 п.о. (rapid run) до 2 × 150 п.о. (high output) |
Сравнение наборов
|
Nextera DNA Flex Library Prep Kit |
TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA Nano | |
|---|---|---|---|
|
Время анализа |
~ 3-4 часа (от выделения ДНК до нормализованной библиотеки) | 5 часов - общее время анализа |
~6 часов - общее время анализа |
| Время непосредственно ручной работы | 1-1,5 часа | 4 часа |
~4 часа |
| Количество стартового материала |
Малые геномы (например, микробы): 1-500 нг ДНК. Большие геномы (например, человека): 100-500 нг ДНК. |
1 мкг ДНК | 100 нг геномной ДНК |
| Описание |
Быстрый, универсальный рабочий процесс для целого комплекса исследовательских применений и типов образцов: подходит для полногеномного секвенирования и микробов, и человека; и многого другого. |
Простая PCR-free пробоподготовка для полногеномного секвенирования с возможностью секвенировать сложные участки генома. | Набор для работы с малым количеством стартового материала, который обеспечивает высокое качество покрытия генома и снижает ошибки. |
| Механизм действия |
bead-linked transposome |
Механическая фрагментация ДНК и лигирование адаптеров. PCR-free. Gel-free. |
Механическая фрагментация ДНК и лигирование адаптеров. Reduced-bias PCR. Gel-free. |
| Мультиплексирование | до 96 доступных уникальных двойных индексов | до 24 одиночных, 96 комбинаторных (CD) двойных, 24 уникальных двойных и 96 уникальных двойных (UD) комбинаций (скоро будет доступно) |
до 24 одиночных, 96 комбинаторных (CD) двойных, 24 уникальных двойных и 96 уникальных двойных (UD) комбинаций (скоро будет доступно) |
|
Таргетный размер вставки |
~500 п.о. |
350 п.о. or 550 п.о. |
350 п.о. or 550 п.о. |
|
Для исследования каких видов подходит |
Любые виды, бактерии, дрозофилы, люди, млекопитающие, мыши, нематоды, растения, крысы, вирусы, дрожжи, данио |
Человек, Млекопитающие, Мышь, Другие, Растения, Крыса | Человек, Млекопитающие, Мышь, Другие, Растения, Крыса |
| Метод |
Секвенирование ампликонов, De Novo секвенирование, Shotgun секвенирование, Полногеномное секвенирование |
Генотипирование с помощью секвенирования, Shotgun секвенирование, Полногеномное секвенирование |
Генотипирование с помощью секвенирования, Shotgun секвенирование, Полногеномное секвенирование |
| Специальные типы образцов |
Кровь, несовместимые с FFPE, слюна |
несовместимые с FFPE |
Малое количество стартового материала; несовместимые с FFPE |
Химия с транспозомами, присоединёнными к шарикам
(A) Связанные с шариками транспозомы обеспечивают одновременную фрагментацию gDNA и добавление праймеров для секвенирования Illumina. (B) ПЦР-амплификация с сокращённым циклом амплифицирует готовые к секвенированию фрагменты ДНК и добавляет индексы и адаптеры. (C) Готовые к секвенированию фрагменты промываются и пулируются.
библиотек для: