TruSight Cardio

TruSight Cardio Sequencing Kit предоставляет собой комплексное, экономически эффективное решение для выявления вариантов, выступающих причиной наследственных заболеваний сердца.

TruSight Cardio Sequencing Kit

Этот набор предоставляет собой комплексное, экономически эффективное решение для обнаружения вариантов, ассоциированных с наследственными заболеваниями сердечно-сосудистой системы.

  • Данная панель разработана в сотрудничестве с Имперским колледжем Лондона (Imperial College of London)

  • 99% таргетных областей имеют не менее 20-кратного покрытия (по данным Illumina Inc., 2015)

  • Стоимость секвенирования составляет ~1 доллар США за ген; полностью поддерживается платформами для секвенирования и ПО по биоинформатики от Illumina


TruSight Cardio Kit включает в себя 174 гена, ассоциирующихся с 17 сердечно-сосудистымии заболеваниями, включая кардиомиопатии, аритмии, аортопатии и многое другое. Гены были тщательно отобраны исследователями из Национального кардиологического центра Сингапура и Лондонского имперского колледжа. Набор включает как гены, о которых известно, что они связаны с наследственным заболеванием сердца, так и гены, связь которых с сердечно-сосудистыми заболеваниями была опубликована в авторитетных источниках (Pua CJ, Bhalshankar J, Miao K, et al. Development of a comprehensive sequencing assay for inherited cardiac condition genes. J Cardiovasc Trans Res. 2016;9:3).

Спецификации

Количество стартового материала 50 нг ДНК
Описание Таргетная панель для выявления вариантов, связанных с 17 наследственными заболеваниями сердца.
Особенности содержимого 575 Kb геномного содержимого (174 гена)
 Мультиплексирование До 96-plex
Для работы с какими платформами подходит MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме), NextSeq 500
Класс вариантов Герминальные варианты, однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs)
Тип нуклеиновой кислоты ДНК
Специализированные типы образцов Несовместимые с FFPE
Метод Таргетное Обогащение, Таргетное ДНК Секвенирование
Для исследования каких видов подходит Человек
Технология Секвенирование

Рекомендации по проекту

Секвенатор
Рекомендуемое количество образцов Длина прочтения
MiSeq 
12 образцов за запуск - реагенты v2 (на основе 300-кратного среднего покрытия таргетного содержимого)
до 2 х 150 п.о.
NextSeq 550               48 образцов за запуск: mid output (на основе 300-кратного среднего покрытия таргетного содержимого)
до 2 х 150 п.о.

Сравнение наборов

       TruSight Cardio Sequencing Kit
TruSight One Sequencing Panels
TruSight Inherited Disease 
Особенности содержимого
575 Kb геномного контента (174 гена)
TruSight One: ~12 Mb геномного контента (~4800 генов). 
TruSight One Expanded: ~16.5 Mb геномного контента (~6700 генов).
2,25 Mb геномного содержимого (552 гена)
Количество стартового материала 50 нг ДНК
50 нг ДНК
50 нг ДНК
Описание Таргетная панель для выявления вариантов, связанных с 17 наследственными заболеваниями сердца.
Готовая панель, нацеленная на изучение участков экзона, которые содержат варианты, вызывающие болезни. Готовая панель, нацеленная на изучение тяжелых педиатрических расстройств
Мультиплексирование До 96-плекс
До 96-плекс
До 96-плекс
Для исследования каких видов подходит
Человек
Человек Человек
Метод Таргетное Обогащение, Таргетное ДНК Секвенирование
Таргетное Обогащение, Таргетное ДНК Секвенирование
Таргетное Обогащение, Таргетное ДНК Секвенирование
 Специальные типы образцов Несовместимые с FFPE
Несовместимые с FFPE
Несовместимые с FFPE

Пример рабочего процесса для конкретного метода
Подготовка
библиотек с помощью:
Секвенирование на:
MiSeq System
NextSeq 550 System
Анализ данных с помощью:

Видеоссылки